Situada davant l’església parroquial de Sant Miquel, és un dels llocs més significatius de la població i, probablement, ja fou aprofitada en època romana i musulmana. Està documentada ja a partir de l’any 1254.

El nom de “Santa Margalida” té el seu origen en un fet succeït l’any 1490. A causa d’una gran sequera que afectà a tota l’illa de Mallorca, el poble de Felanitx va organitzar rogatives i processons per demanar aigua. Els jurats del poble decidiren aprofundir la font i, a 18 pams de fondària, aquesta brollà amb abundor. Era el 20 de juliol de l’any 1490, dia de Santa Margalida. Per commemorar aquest fet, la font va rebre el nom de la santa i es va decidir que Santa Margalida fos la patrona del poble.

La font ha sofert moltes reformes. D’entre totes, destaca la darrera, duta a terme entre els anys 1829 i 1833 i projectada pel mestre Llorenç Rovira, el qual li atorgà la singular forma de ferradura de cavall que té actualment. Des de l’any 2017, la imatge de la Nit de l’Art de Felanitx està inspirada en la Font de Santa Margalida.

Moltes llegendes tenen la Font com a protagonista, com ara la llegenda del cavall sedegós o la de na Maria Enganxa.